A explicat: Coronavirusul mutant comparativ cu teste, vaccinuri

Noile vaccinuri și teste coronavirus vs Covid-19: Varianta de coronavirus care circulă în Marea Britanie este definită de multe mutații. Care sunt de interes deosebit? De ce a sfătuit OMS că poate evita unele teste PCR și poate avea impact asupra vaccinării?

O fiolă cu vaccinul Pfizer-BioNTech Covid-19 la Spitalul Guy din Londra. În timp ce virusul a suferit mutații în unele zone, majoritatea vaccinurilor vizează mai multe părți. (AP Foto: Frank Augstein)

În informațiile emergente despre noua variantă a coronavirusului SARS-CoV-2 care circulă în Marea Britanie, o mutație a fost deosebit de îngrijorătoare. Varianta, numită VUI 202012/01 și raportată ca fiind capabilă să se transmită mai rapid printre oameni, este definită de până la 14 mutații și trei ștergeri în materialul său genetic. De îngrijorare deosebită este o mutație, N501Y. În timp ce potențialul variantei de a avea impact asupra testelor și a rezultatelor vaccinării este încă studiat, autoritățile sanitare sunt în mare parte optimiste că majoritatea testelor și vaccinurilor vor funcționa în continuare.

Ce este o mutație?

O mutație înseamnă o modificare a materialului genetic. Într-un virus ARN, cum ar fi SARS-CoV-2, proteinele sunt formate dintr-o secvență de aminoacizi. Un astfel de virus conține aproximativ 30.000 de „perechi de baze”, care sunt ca cărămizile așezate una lângă cealaltă pentru a forma o structură. O modificare a acestei baze poate fi o mutație, schimbând efectiv forma și comportamentul virusului.

În varianta din Marea Britanie, o mutație a făcut ca virusul să se lege mai mult de proteinele umane numite receptori. Acesta se numește N501Y.

Ce este N501Y?

Cu cuvinte simple, aminoacidul reprezentat de litera N, și prezent la poziția 501 în structura genetică a coronavirusului, a fost înlocuit în acea poziție cu un alt aminoacid, reprezentat de Y. Poziția în care a avut loc această alterare este în domeniul de legare la receptor al proteinei spike. (Este proteina de vârf a virusului care se leagă de receptorul uman.)

Prin urmare, mutația a crescut afinitatea de legare a coronavirusului. Se pare că virusul mutant reprezintă 60% din infecțiile recente din Londra.

Conform bazei de date Global Initiative on Sharing Avian Influenza Data (GISAID), aceeași mutație în domeniul de legare la receptor a fost raportată independent în mai multe țări, inclusiv Africa de Sud și Australia. Analiza secvenței a arătat că această mutație își are originea separat în Marea Britanie și Africa de Sud.

Dar celelalte mutații ale coronavirusului?

Mutațiile sunt comune, dar majoritatea dintre ele cauzează nici o modificare în structura proteinele pe care le codifică - acestea sunt numite mutații „sinonime“, deoarece acestea traduce în cele din urmă la aceleași aminoacizi. Un alt tip este „non-sinonim“ mutație, care ar putea duce la un amino schimbare acidă.

În varianta care circulă în Marea Britanie, există șase modificări sinonime și paisprezece mutații non-sinonime. În plus, există trei „deleții” - aminoacizi îndepărtați din secvență.

Potrivit Organizației Mondiale a Sănătății (OMS), altele decât N501Y, mutațiile care pot influența transmisibilitatea virusului la om sunt P681H și HV 69/70.

Și ce sunt P681H și HV 69/70?

P681H : Această mutație a avut loc în aminoacidul prezent la 681 - o altă poziție în domeniul de legare la receptor. Aici aminoacidul P a fost înlocuit cu H. Centrele pentru Controlul Bolilor din SUA (CDC) au spus că acesta este un loc cu o variabilitate mare a coronavirusurilor și că această mutație specifică a apărut, de asemenea, spontan de mai multe ori. OMS a spus că această mutație are o semnificație biologică.

Cercetătorii au arătat mai devreme că această mutație poate promova intrarea in celulele epiteliale respiratorii și transmiterea în modele animale.

Probele recente secvențiate la Centrul African de Excelență pentru Genomica Bolilor Infecțioase, Universitatea Redeemer, Nigeria au arătat secvența P681H acolo. Cu toate acestea, cercetătorii spun că, în prezent, nu au dovezi care să indice că varianta P681H contribuie la creșterea transmiterii virusului în Nigeria.

HV 69/70 : Această mutație este rezultatul unei ștergeri a aminoacizilor la pozițiile 69 și 70. Aceste poziții sunt din nou în proteina spike a virusului. Această ștergere a fost observată și în Franța și Africa de Sud. CDC a spus: Această dublă ștergere a avut loc în mod spontan de multe ori și probabil duce la o schimbare a formei (adică, o schimbare conformațională a) proteinei spike.

Cercetătorii din partea COVID-19 Genomics Consortium UK (CoG-UK), care a semnalat noua variantă în Marea Britanie, au declarat în raportul lor preliminar că această ștergere a fost observată și într-un focar asociat nurcii în Danemarca. La om, această deleție a fost asociată cu o altă mutație, N439K, care a apărut din nou în domeniul de legare la receptor.

OMS a subliniat că această ștergere poate afecta performanța unor teste RT-PCR care detectează noul coronavirus.

Cum poate afecta testele RT-PCR?

OMS a spus că s-a descoperit că ștergerea la pozițiile 69/70 afectează performanța unor teste PCR de diagnostic care utilizează o „țintă a genei S” (în „S” sau proteina spike). Cu toate acestea, OMS a mai spus că majoritatea testelor PCR din întreaga lume folosesc mai multe ținte și, prin urmare, impactul variantei asupra diagnosticului nu este anticipat a fi semnificativ.

De asemenea, CDC a spus că majoritatea testelor PCR comerciale au mai multe ținte în care detectează virusul, astfel încât, chiar dacă o mutație afectează una dintre ținte, celelalte ținte PCR vor funcționa în continuare.

De fapt, infecția declanșată de noua tulpină și în Marea Britanie a fost detectată prin testul RT-PCR convențional.

Laboratoarele care folosesc testele PCR in-house care vizeaza gena S a virusului ar trebui să fie conștienți de această problemă potențială. Pentru a limita impactul asupra capacităților de detecție în țările, o abordare folosind diferite analize in testele paralele sau multiplex care vizează diferite gene virale este de asemenea recomandată pentru a permite detectarea posibilelor variante care apar, OMS a recomandat.

Va afecta dezvoltarea vaccinului?

CDC a spus că vaccinurile aprobate de Administrația SUA pentru Alimente și Medicamente (FDA) sunt policlonale, producând anticorpi care vizează mai multe părți ale proteinei spike.

Virusul ar trebui probabil să acumuleze mutații multiple în proteina spike pentru a se sustrage imunității induse de vaccinuri sau de infecția naturală, se spune.

Și OMS a spus: Studiile de laborator sunt in curs de desfasurare pentru a determina dacă aceste virusuri variante au proprietăți biologice diferite sau eficacitatea vaccinului alter. Nu există suficiente informații, în prezent, pentru a determina dacă această variantă este asociată cu orice schimbare in severitatea bolii clinice, raspuns de anticorpi sau eficacitatea vaccinului.

debrah filme farentino și emisiuni TV

Imparte Cu Prietenii Tai: